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单细胞水平的病毒转录组测序服务

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随着现代生物医学研究技术的逐步深入和高通量测序技术的不断精进,高通量单细胞测序技术也顺应而生,并在生物医学研究的多个领域得到广泛应用。高通量单细胞测序技术主要通过定量研究单细胞内的mRNA转录组、蛋白表达谱、抗体VDJ组合信息以及染色质可及性等多方面信息,综合展示单细胞水平上的细胞异质性。

随着单细胞技术的发展,越来越多病毒研究领域的学者,尝试用高通量单细胞测序这个新式武器,针对隐匿在细胞中的病毒一探究竟。但考虑到病毒普遍具备以下几个特点:

1)有明确的宿主细胞特异性,即同一组织内仅感染特定的细胞类型;

2)体内环境下,病毒阳性感染的细胞比例极低;

3)相对于宿主细胞,单个细胞内的病毒mRNA分子数很少。

这导致利用常规的高通量单细胞测序分析方法,很难直接检测到某个细胞内痕量的病毒mRNA分子。

为了解决这一问题,中科普瑞单细胞技术平台收集建立了一个包含多达10000余种病毒基因组序列信息的病毒信息数据库,并搭建了一套适用于多平台(BD或10X)的单细胞病毒转录组分析流程。利用病毒数据库+病毒分析流程,得以从单细胞转录组的角度,研究病毒和宿主细胞的相互作用。

应用范围

通过单细胞病毒转录组分析,我们在单细胞水平研究:

²当前组织中感染了哪(些)类病毒;

²哪些细胞类型是病毒的宿主细胞,易感细胞具有什么特征表达谱;

²病毒在宿主细胞内表达了哪些转录本,丰度如何;

²在病毒感染前后,宿主细胞转录组发生哪些相应的改变。

结果展示

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