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单细胞核转录组测序服务

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由于单细胞RNA测序(scRNA-seq)对于器官或者固体组织制备的细胞悬液的细胞活性和细胞数目有着较高的要求,受限于样本解离过程,主要存在以下问题:

²仅适用于新鲜组织样本,对于冻存样本,由于细胞已经丧失活性,因此无法开展单细胞测序。

²解离过程会诱导应激基因的表达,引起细胞转录模式发生“人为改变”(artifactual transcriptional stress responses),造成转录偏好(bias)。这样获得的数据无法真实的反应样本的细胞转录状态,结果的可靠性大大降低。

²对于很多实体组织,如脑、心脏、肾脏等,蛋白酶倾向于将易于解离的细胞类型解离下来,因此会丢失不易解离的细胞;同时一些较为敏感的细胞可能会因为解离过度而破碎。这样,解离过程无法有效的获取到组织中的所有细胞类型,结果的准确性大为降低。

这就意味着 “躺在”超低温冰箱中的大量珍贵临床样本都无法进行scRNA测序。而单细胞核RNA测序技术(snRNA-seq)的出现,则在很大程度上解决了以上问题。

单细胞核转录组测序(Single Nuclei RNA Sequencing,snRNA-seq)是通过提取样本单细胞核,基于单细胞测序平台分离、标记细胞核,在单细胞水平研究核基因表达检测的技术。为脑组织、心脏、肾脏等复杂组织或一些珍稀冻存样品提供了单细胞水平研究应用平台,可挖掘更多潜在的致病细胞类型,更易于探讨肿瘤细胞异质性和致病机理。

 

适用范围

²冻存组织样品;克服新鲜样品时效性限制;

²难以制备单细胞悬液的组织样品;

²减少解离偏差,能更好地保留细胞类型多样性;

²不需要酶促消化,真实反映细胞的组分。

 

服务优势

²操作简单:采用直接抽核方式,而且核膜比细胞膜稳定,操作相对简单;

²适用范围广:新鲜/冻存、难消化、复杂组织类型均可,并且无细胞粒径活性局限;

²结果精准:解离过程中无人为引入“转录偏好”,结果真实可靠;

²信息全面:组织细胞消化均一性好,获取真实的细胞类型组成和比例,鉴定细胞类型更全面和完整。

 

样本要求

²样本取样:组织重量>100mg,冰冻组织抽核的临床手术样本及新鲜组织取样后尽快进行液氮速冻,抽核前提取RNA进行RIN值检测,RIN≥7;新鲜组织抽核样本,离体后须尽快放到加入组织保存液的EP管中;

²样本保存:冷冻样本-80℃保存,建议保存时间≤6个月;新鲜组织取样后建议48h内运输至公司;

²样本运输:新鲜组织4℃冰袋运输;冷冻样本干冰运输。


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